击败各个道馆馆主后不仅能获得徽章，还能解锁特定的秘传技能（HM）或技巧机器（TM）。这些技能对推进剧情和探索地图至关重要。击败枯叶市的电系道馆馆主马志士后，可获得HM01一字斩，用于砍断挡路的小树；战胜华蓝市的水系道馆馆主小霞后，能学会TM03水之波动，增强水属性攻击能力。
第七个道馆位于羽毛市，击败馆主布罗克后可获得HM05火焰冲击。这一技能不仅能用于战斗，还能在特定场景中清除障碍物。需火焰冲击属于火属性技能，对草系、虫系和冰系宝可梦效果显著。战胜彩虹市的草系道馆馆主莉佳后，玩家会获得TM19亿万吸收，这是一种草系技能，能在攻击对手的同时恢复自身HP，实用性较高。
在紫苑镇附近的道馆挑战中，击败馆主后通常可获得闪光（HM05）或怪力（HM04）等技能。闪光能照亮黑暗的洞穴，如岩山隧道；怪力则用于移动地图上的巨石，解决谜题。这些技能不仅限于战斗用途，更是探索隐藏区域的关键。使用怪力推开巨石后，可能发现稀有道具或宝可梦的栖息地。
通关所有道馆后，玩家将掌握全部秘传技能，包括冲浪（HM03）、飞空术（HM02）等。冲浪允许在水域移动，并触发双打战斗；飞空术能快速返回已访问的城镇。这些技能极大提升了游戏效率，但需注意技能机通常只能使用一次，因此需谨慎分配。部分技能如飞空术需在特定地点学习，并非直接通过道馆获得。
水属性宝可梦学习冲浪后能发挥双重作用，既作为交通工具又强化战斗能力。建议在挑战道馆前提前规划技能分配，以最大化队伍的综合实力。通过合理利用这些技能，玩家能更高效地完成游戏主线并探索隐藏内容。
