在停止舰船行驶时，首要考虑的是当前舰队的战斗状态和计划圈部署情况。若舰队处于战斗状态，系统会自动转换为战斗编队，无法手动干预舰船排列顺序。停止行动前需确认是否已完成当前战斗任务或是否需要紧急撤退。撤退指令一旦下达，舰队将返回所属基地或前哨站，但需注意撤退过程中可能暴露基地位置。
停止舰船行驶的另一关键因素是资源采集任务的衔接。工程舰在采矿过程中若需紧急停止，必须优先处理仓储资源转移问题。工程舰与运输舰混编可提升采矿效率，但停止作业时需确保资源已妥善存放于基地或运输舰内。若计划圈内存在未采集完成的矿区，强行停止可能导致资源浪费或计划圈策略值损耗。
若舰队处于敌方侦查范围内，突然停止可能引发敌方针对性打击。建议在安全区域或己方封锁范围内执行停止操作，同时利用侦查舰提前探测周边敌情。封锁任务中的舰队需特别注意停止时机，避免因野怪刷新机制导致经验损失或意外战损。
技术层面需关注舰船维修与蓝图研究状态。停止行驶后受损舰船必须返回基地船坞维修，预制模块无法在野外维修。若舰队携带正在研究的蓝图档案，停止行驶可能导致研究进度中断，且蓝图研究无法替换或取消。星币加速虽可缩短研究时间，但需权衡资源消耗合理性。
停止舰船行驶的最终决策需综合指挥值限制与增援机制。战巡或航母等高指挥值舰船停止后重新部署可能面临编队限制，可利用增援功能突破人口上限，但需注意增援会导致曲率航行失效。多段曲率调动的舰队停止时，应优先确保侦查舰定位坐标准确性，避免后续增援舰队偏离目标位置。
