飞行能力并非通用技能，而是通过多种特殊忍术或血继限界实现的罕见能力。这些飞行方式在游戏中的还原度较高，但部分机制与物理常识存在明显差异。掌握这些飞行技巧对于战斗中的机动性和战术布局至关重要，尤其在需要高空压制或快速转移的场景中。
最常见的飞行方式是利用忍术制造载体，例如迪达拉的黏土大鸟或佐井的超兽伪画。这类忍术的本质是将查克拉转化为实体载具，但游戏中的表现往往忽略载具的耐久度问题。土影一脉的超轻重岩之术则更为特殊，通过改变自身或物体的重力实现悬浮，但游戏未明确展示查克拉消耗与飞行时间的关联性。这种设定虽简化了操作，却也削弱了原作中忍术的复杂性。
血继限界带来的飞行能力更具争议性，例如须佐能乎的翅膀或轮回眼的引力操控。游戏将这类能力归类为角色专属技能，但未解释为何仅部分角色能触发飞行形态。小南的纸遁飞行在游戏中表现为短暂无敌状态，这与原作中持续飞行的设定存在偏差。七尾人柱力的蝶羽飞行则被简化为固定技能CD，未体现尾兽查克拉的持续性消耗机制。
六道之力持有者的飞行设定最为特殊，游戏将其表现为无消耗的常态能力。这种设计虽强化了角色强度，却与原作中六道级需主动操控求道玉的设定不符。部分通灵兽如蛤蟆或鹰的飞行功能在游戏中受场景限制，无法在封闭地形使用，这与原作中通灵兽的全地形适应性产生矛盾。
游戏对飞行能力的还原兼顾了操作性与原作特色，但在能量消耗、持续时间等细节上存在简化。玩家需注意不同飞行方式的战术差异，例如载体类飞行适合远程牵制，而血继类飞行更利于近战突击。理解这些机制有助于在实战中最大化飞行能力的战略价值。
